Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim12cD3Z3L3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim12cD3Z3L3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms