Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930467E23RikD3Z1P8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms