Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc170D3YXL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc170D3YXL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc170D3YXL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc170D3YXL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms