Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samd1D3YXK1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samd1D3YXK1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samd1D3YXK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms