Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rexo5D3YW29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rexo5D3YW29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rexo5D3YW29 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms