Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nxpe3B9EKK6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe3B9EKK6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe3B9EKK6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms