Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pnldc1B2RXZ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pnldc1B2RXZ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms