Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Siah3B2RWG3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Siah3B2RWG3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms