Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clrn2B2RVW2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn2B2RVW2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clrn2B2RVW2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms