Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfc3h1B2RT41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfc3h1B2RT41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfc3h1B2RT41 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfc3h1B2RT41 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfc3h1B2RT41 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfc3h1B2RT41 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms