Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Brpf1B2RRD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brpf1B2RRD7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brpf1B2RRD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms