Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scml2B1AVB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scml2B1AVB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scml2B1AVB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scml2B1AVB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scml2B1AVB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms