Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700084M14RikB1AT01 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700084M14RikB1AT01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700084M14RikB1AT01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms