Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV3

Lao1, Amine oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lao1B1ARV3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lao1B1ARV3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lao1B1ARV3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lao1B1ARV3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms