Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp36B1AQJ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp36B1AQJ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp36B1AQJ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms