Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint7A7XV04 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint7A7XV04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint7A7XV04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint7A7XV04 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint7A7XV04 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms