Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint6A7XUZ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint6A7XUZ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint6A7XUZ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms