Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skint2A7XUX6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skint2A7XUX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skint2A7XUX6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms