Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skint3A7TZF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint3A7TZF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skint3A7TZF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms