Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Odf2A3KGV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Odf2A3KGV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Odf2A3KGV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms