Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc9bA3KGF9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc9bA3KGF9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc9bA3KGF9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms