Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn1aA2APX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn1aA2APX8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn1aA2APX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms