Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FocadA2AKG8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FocadA2AKG8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FocadA2AKG8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FocadA2AKG8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 699.6 ms