Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm11A2AGX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm11A2AGX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm11A2AGX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms