Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2dnl2A2AFH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2dnl2A2AFH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms