Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rbbp8nlA2ABX0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp8nlA2ABX0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms