Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chd5A2A8L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chd5A2A8L1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd5A2A8L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms