Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1bA1Z198 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms