Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam71e1A1L3C1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fam71e1A1L3C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam71e1A1L3C1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms