Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc173A0JLY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc173A0JLY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms