Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfap99A0A140LIX9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cfap99A0A140LIX9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap99A0A140LIX9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap99A0A140LIX9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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