Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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