Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm28919A0A087WP35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28919A0A087WP35 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
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