Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2aQ9Z255 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2aQ9Z255 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2aQ9Z255 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2aQ9Z255 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2aQ9Z255 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2aQ9Z255 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2aQ9Z255 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2aQ9Z255 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2aQ9Z255 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2aQ9Z255 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2aQ9Z255 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2aQ9Z255 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2aQ9Z255 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2aQ9Z255 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2aQ9Z255 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2aQ9Z255 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2aQ9Z255 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2aQ9Z255 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2aQ9Z255 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2aQ9Z255 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2aQ9Z255 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2aQ9Z255 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2aQ9Z255 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms