Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SelenofQ9ERR7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelenofQ9ERR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SelenofQ9ERR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SelenofQ9ERR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelenofQ9ERR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenofQ9ERR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SelenofQ9ERR7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenofQ9ERR7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenofQ9ERR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SelenofQ9ERR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenofQ9ERR7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenofQ9ERR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenofQ9ERR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SelenofQ9ERR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenofQ9ERR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenofQ9ERR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenofQ9ERR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenofQ9ERR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SelenofQ9ERR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SelenofQ9ERR7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SelenofQ9ERR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SelenofQ9ERR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SelenofQ9ERR7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenofQ9ERR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SelenofQ9ERR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SelenofQ9ERR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SelenofQ9ERR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelenofQ9ERR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelenofQ9ERR7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelenofQ9ERR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelenofQ9ERR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelenofQ9ERR7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SelenofQ9ERR7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SelenofQ9ERR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SelenofQ9ERR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenofQ9ERR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SelenofQ9ERR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SelenofQ9ERR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SelenofQ9ERR7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SelenofQ9ERR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SelenofQ9ERR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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