Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hrct1Q9D6B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hrct1Q9D6B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hrct1Q9D6B9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hrct1Q9D6B9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hrct1Q9D6B9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hrct1Q9D6B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hrct1Q9D6B9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hrct1Q9D6B9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hrct1Q9D6B9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hrct1Q9D6B9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hrct1Q9D6B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hrct1Q9D6B9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hrct1Q9D6B9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hrct1Q9D6B9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hrct1Q9D6B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hrct1Q9D6B9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hrct1Q9D6B9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hrct1Q9D6B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hrct1Q9D6B9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hrct1Q9D6B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hrct1Q9D6B9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hrct1Q9D6B9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hrct1Q9D6B9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hrct1Q9D6B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hrct1Q9D6B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hrct1Q9D6B9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hrct1Q9D6B9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hrct1Q9D6B9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hrct1Q9D6B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hrct1Q9D6B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms