Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Prdm4Q80V63 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Prdm4Q80V63 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Prdm4Q80V63 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Prdm4Q80V63 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Prdm4Q80V63 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Prdm4Q80V63 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Prdm4Q80V63 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Prdm4Q80V63 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Prdm4Q80V63 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Prdm4Q80V63 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Prdm4Q80V63 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Prdm4Q80V63 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Prdm4Q80V63 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Prdm4Q80V63 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Prdm4Q80V63 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Prdm4Q80V63 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Prdm4Q80V63 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Prdm4Q80V63 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Prdm4Q80V63 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Prdm4Q80V63 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Prdm4Q80V63 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Prdm4Q80V63 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Prdm4Q80V63 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Prdm4Q80V63 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Prdm4Q80V63 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Prdm4Q80V63 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Prdm4Q80V63 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Prdm4Q80V63 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Prdm4Q80V63 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Prdm4Q80V63 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Prdm4Q80V63 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Prdm4Q80V63 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Prdm4Q80V63 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Prdm4Q80V63 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Prdm4Q80V63 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Prdm4Q80V63 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Prdm4Q80V63 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Prdm4Q80V63 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Prdm4Q80V63 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Prdm4Q80V63 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Prdm4Q80V63 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Prdm4Q80V63 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Prdm4Q80V63 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,54■■■□□ 2
Prdm4Q80V63 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Prdm4Q80V63 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Prdm4Q80V63 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Prdm4Q80V63 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Prdm4Q80V63 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Prdm4Q80V63 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Prdm4Q80V63 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Prdm4Q80V63 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Prdm4Q80V63 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Prdm4Q80V63 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Prdm4Q80V63 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Prdm4Q80V63 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Prdm4Q80V63 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Prdm4Q80V63 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Prdm4Q80V63 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Prdm4Q80V63 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Prdm4Q80V63 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Prdm4Q80V63 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Prdm4Q80V63 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Prdm4Q80V63 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms