Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tnp1P10856 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp1P10856 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnp1P10856 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnp1P10856 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnp1P10856 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnp1P10856 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnp1P10856 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp1P10856 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnp1P10856 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnp1P10856 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms