Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrit3W8DXL4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms