Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3550W4VSN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm3550W4VSN7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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