Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vamp5Q9Z2P8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vamp5Q9Z2P8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms