Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Crlf3Q9Z2L7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Crlf3Q9Z2L7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Crlf3Q9Z2L7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Crlf3Q9Z2L7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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