Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn6Q9Z262 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms