Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ilf3Q9Z1X4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms