Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Snx1Q9WV80 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx1Q9WV80 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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