Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pfdn5Q9WU28 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pfdn5Q9WU28 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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