Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sema6cQ9WTM3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms