Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nek3Q9R0A5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms