Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AmfrQ9R049 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms