Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tomm40Q9QYA2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tomm40Q9QYA2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms